arcRNAタクソンは、核内に大量に蓄積し特定の核内構造体の骨格となる一群のncRNAの総称です。arcRNAの機能はこれまで主に培養細胞および初代培養で解析されてきましたが、実際に個体レベルでどのような生理機能を果たしているか、長らく不明でした。
本研究では、代表的なarcRNAであるNeat1、Malat1、Gomafuのノックアウトマウスの表現型解析を行い、arcRNAが制御する細胞内プロセスの詳細を明らかにします。特に、核内構造体パラスペックルの骨格因子であるNeat1ノックアウトマウスが、黄体機能不全による著しい妊孕性の低下という表現型を示すことが明らかになりつつありますので、この系をモデルシステムとして用い、arcRNAとその結合タンパク質が作る超分子複合体が制御する細胞内プロセスを、生化学的解析や複合体の細胞内挙動の詳細な解析を通じて明らかにします。
また、特定のRNAに対するアンチセンスオリゴDNAを用い、RNA-タンパク質超分子複合体をシステマティックに精製する技術を確立することを目指します。また、そこで培われた基盤技術は、領域内で同定されたその他のarcRNAタクソンに属するncRNAの機能解析にも応用していきます。
さらに、計画研究1や計画研究2と連携し、新規に同定されたRNA修飾酵素やarcRNAのノックアウトマウスを作製し、個体レベルでの機能解析をすすめていきます。
