いくつかのRNAの機能が、配列ではなく、それらが織り成す構造によって規定されているように「作動エレメント」に加わる重要な要素としてRNAの高次構造があげられます。しかし高次構造を重要視した作動エレメントの解析手法、特に大規模解析手法は発展途上にあります。既存の手法では特定の細胞に内在するRNAを元に実験・解析を行うために、特定の細胞条件に依存した解析結果に陥る点や、高度に構造をとったRNAを十分に解析できない点に改良の余地がありました。加えて、網羅的検出技術が開発されていない機能性RNAも存在しており，RNAが有する多彩な機能への理解を阻んでいました。上述の問題を解決するために、本研究では独自に開発した「RNA構造ライブラリ」を用いて作動エレメントとして重要なRNAの配列と高次構造を網羅的に解析する新技術を創出します。さらに幅広い種類の機能に対してRNA構造ライブラリを用いた解析を実施することで、従来の機能性RNAの研究手法を革新し、配列と高次構造の観点からncRNAの機能アノテーションを拡充することを目指します。
